дельта плюс коронавирус в каких странах
На штамм впереди: чем опасен вариант коронавируса «Дельта плюс»
Последовательности мутировавшего штамма коронавируса «Дельта» идентифицированы в образцах пациентов из 10 стран, сообщили ученые. У нового варианта SARS-CoV-2 «Дельта плюс» есть одна значимая мутация в шиповидном белке, который отвечает за проникновение в клетку. Уже сейчас есть предположения, что «Дельта плюс» не поддается лечению созданными в лаборатории антителами, однако делать вывод о его однозначной большей опасности еще рано, считают эксперты.
Точки роста
В мае ВОЗ признала, что в новом повороте пандемии COVID-19 большую роль сыграл индийский штамм B.1.617.2, который назвали «Дельта». В некоторых странах, в том числе в России, этот вариант коронавируса активно вытесняет другие, демонстрируя большую заразность. Теперь стало ясно, что штамм «Дельта» тоже мутировал и появился вариант «Дельта плюс», или AY.1. По первоначальным данным, этот штамм проявляет признаки устойчивости к лечению моноклональными антителами (антитела, разработанные в лаборатории и вводимые пациентам в рамках специализированной терапии), сообщали индийские СМИ.
Российские эксперты считают, что новый вариант может выиграть эволюционную гонку со штаммом «Дельта». Велика вероятность, что мутировавший индийский штамм представляет большую опасность, сказал «Известиям» вирусолог, руководитель лаборатории геномной инженерии МФТИ Павел Волчков.
— Индия имела все шансы стать страной № 1 по «производству» новых штаммов, и теперь она точно закрепилась на этом месте, — отметил эксперт. — Так будет и дальше, если не произойдет ничего сверхъестественного. Конечно, мы слышали заявления индийских врачей о том, что вот-вот начнется тотальная вакцинация, но на это нужно как минимум полгода-год. И за это время мы увидим еще много вариантов штамма «Дельта». Индия всё время будет выдавать нам апдейт SARS-CoV-2.
По сообщению ученых, которые специализируются на секвенировании, «на сегодняшний день геномы «Дельта плюс» были идентифицированы в десяти странах».
Новая мутация
Главное, что отличает вариант «Дельта» от «Дельта плюс», — мутация K417N.
— Это мутация в гене шиповидного белка, которая ведет к замене аминокислоты лизин (К) на аминокислоту аспарагин (N) этого белка в позиции 417, которая находится в так называемом рецептор-связывающем домейне (receptor-binding domain — RBD), который отвечает за связывание вириона с рецепторами на поверхности клеток человека, — объяснил профессор кафедры геномики и биоинформатики СФУ, профессор Геттингенского университета Константин Крутовский. — Поэтому эта мутация вызывает особый интерес.
По словам генетика, она уже была известна в разных штаммах, но на этот раз произошла в варианте «Дельта», у которого ученые уже обнаружили повышенную способность связываться с рецепторами клеток человека и повышенную инфекционность. Новая мутация выглядит как опасная, но, чтобы это подтвердить, нужны дополнительные исследования, подчеркнул Константин Крутовский.
Агентство общественного здравоохранения Англии (Public Health England) в своем последнем отчете о вариантах коронавируса сообщило, что по состоянию на 7 июня вариант «Дельта плюс» идентифицирован в шести геномах из Индии. Но в общей сложности ведомство подтвердило наличие 63 геномов варианта усовершенствованных штаммов «Дельта» с новой мутацией K417N.
«Глядя на большой кластер (T95I), кажется, что AY.1 («Дельта плюс») возникал независимо несколько раз и мог быть более распространенным, чем наблюдается в странах с ограниченным геномным надзором», отмечают индийские ученые. Это означает, что специалисты могут не видеть большой процент случаев, вызванных «Дельта плюс».
География вируса
Как сообщают индийские СМИ, 36 образцов, содержащих геном «Дельта плюс», были найдены в Англии. Другие случаи связывают с поездками в Непал, Турцию, Малайзию и Сингапур. Также некоторые образцы пришли из Европы и Америки, что говорит о широкой распространенности этого варианта.
По мнению индийских ученых, эта мутация уклоняется от лечения моноклональными антителами от СOVID-19. Впрочем, это еще требуется доказать, как и то, насколько «Дельта плюс» противостоит известным вакцинам.
— На месте производителей вакцин я бы уже сделал замену нынешнего S-белка на индийскую версию, — сказал Павел Волчков. — Думаю, что в законодательстве России стоит предусмотреть ускоренное происхождение регуляторных процедур для антиковидных вакцин. Так сделано для вируса гриппа, где вакциный состав может меняться без прохождения дополнительных клинических исследований. Такой протокол позволит менять в антиковидных вакцинах один S-белок на другой, не тратя много времени на новые клинические испытания.
По мнению Павла Волчкова, если количество случаев заражения увеличивается и видно, что эта мутация начинает закрепляться в популяции, значит, вирус становится более заразным. Однако, чтобы это установить, нужно последить за развитием событий.
Во Всемирной организации здравоохранения тоже не спешат объявлять вариант «Дельта плюс» более опасным. Этому штамму пока не присвоили статус вызывающего беспокойство. В ВОЗ считают, что за мутацией пока нужно просто наблюдать.
Мутацию коронавируса Delta Plus обнаружили в 10 странах: есть ли угроза для Украины
У индийского штамма коронавируса, которому дали название Delta, обнаружили две мутации. Наибольшую обеспокоенность у медиков и ученых теперь вызывает вариант Delta Plus, который зафиксирован уже в 10 странах мира.
Так, на сегодня, случаи заражения им подтверждены в США, Канаде, Британии, Португалии, Польше, Швейцарии, России, Турции, Японии и Непале, пишет The Guardian. О том, есть ли его угроза для Украины – читайте далее в материале.
Что такое Delta Plus
По словам специалистов, это тот же вариант Delta с дополнительной мутацией под названием K417N. В общем же существует минимум две отдельные группы штамма, известные как Delta AY.1 (является наиболее распространенным) и Delta AY.2.
Когда Delta Plus выявили впервые, его неофициально описали как так называемый непальский вариант, поскольку он был диагностирован у 13 человек, которые путешествовали из Непала в Японию. Хотя возникла ли эта мутация изначально в Непале, неясно.
Общественное здравоохранение Британии рассматривает все три варианта (оригинальный Delta, впервые обнаруженный в Индии, а также Delta AY.1 и Delta AY.2 как вызывающие беспокойство мутации COVID-19. По словам ученых, они могут представлять больший риск, чем исходный вирус. Например, из-за более легкого распространения, частичной устойчивости к вакцинам или иммунитета от предыдущей инфекции.
По состоянию на 18 июня только в Британии было зафиксировано 36 подтвержденных и два вероятных случая инфекции Delta AY.1.
Действуют ли вакцины против Delta Plus
Подчеркивается, что мутация K417N наблюдается и в Beta-варианте COVID-19, впервые обнаруженном в Южной Африке. Она находится в спайковом белке вируса и, как считается, объясняет по крайней мере некоторые из причин, по которым этот штамм частично устойчив к вакцинам.
Эксперты уверяют, что на данный момент все препараты хорошо действуют против варианта Delta, особенно после двух прививок. В то же время органы здравоохранения разных стран немного обеспокоены новыми обнаруженными мутациями. Ведь теперь вновь предстоит выяснить, могут ли они повлиять на защиту вакцины или иммунитет, полученный от предыдущего заражения более старой формой вируса.
Есть ли угроза для Украины
В нашей стране пока не заявлялось об обнаружении варианта коронавируса Delta или его мутации Delta Plus.
Все же Совет национальной безопасности и обороны (СНБО) запланировал на 23 июня срочное заседание на тему борьбы с коронавирусом, а именно угрозы распространения в Украине индийского штамма.
Предполагается, что с целью предотвращения распространения новых мутаций будут возвращены некоторые мероприятия, в частности:
обязательное ПЦР-тестирование людей на границе;
усиление контроля карантинных ограничений;
максимальное ускорение кампании вакцинации;
усиление аналитической работы;
интенсивная подготовка опорных медучреждений к возможной четвертой волне COVID-19.
Напомним: распространение мутировавшего штамма коронавируса Delta из Индии сегодня зафиксировали уже в 92 странах. Он вызывает обеспокоенность у Всемирной организации здравоохранения из-за большей заразности, однако специалисты уверены в эффективности против него всех имеющихся вакцин.
По словам индийских медиков, признаки инфицирования Delta-штаммом описываются как те, что похожи на простуду с головной болью, насморком и болью в горле. Также эксперты предупреждают, что сейчас фиксируют и четыре новых симптома: диарея, нарушение слуха, тяжелые расстройства желудка и тромбы, приводящие к гангрене.
Как сообщал OBOZREVATEL, по словам врача-иммунолога Бориса Донского, Delta-штамм действительно вызывает обеспокоенность. При этом пока не подтверждено, что он может избегать вакцин, применяющихся для защиты от коронавируса.
Важно: контент, размещенный на данной странице OBOZREVATEL, является результатом творческих исследований автора: он может не иметь медицинского образования или научной степени. Текст не проверяется специалистом в области медицины на предмет точности, сбалансированности, объективности. Некоторые публикации содержат подробности лечения или применения лекарственных препаратов. Данная информация не является руководством к действию и должна быть использована только после обсуждения с вашим лечащим врачом. OBOZREVATEL не призывает применять или распространять какие-либо лекарственные препараты, способы лечения и виды медицинских услуг.
Вакцина поможет не всем: штамм-убийца по имени Дельта
Не успели мы выдохнуть весной, когда цифры статистики по заболеваемости ковидом пошли вниз, как уже возникла новая напасть: на смену «классическому» коронавирусу из Китая и британской и южноафриканской его разновидностям пришла новая зараза – с индийского полуострова. Более агрессивная и сложная. Разбираемся, насколько велика угроза и надолго ли к нам явился сначала агрессивный штамм «Дельта», а спустя некоторое время – ещё более злой и страшный его собрат «Дельта плюс».
По всей стране наблюдается стремительное ухудшение ситуации с распространением коронавируса – растут суточные показатели по числу заразившихся, увеличивается количество госпитализаций, но при этом снижаются темпы по выздоровлению.
Регионы, как и год назад, принялись закручивать гайки. Но если тогда, прошлой весной, это были самоизоляция и закрытие различных сфер деятельности, то теперь – ограничения для тех, кто не желает прививаться от ковида.
Вслед за Москвой и Подмосковьем обязательную вакцинацию ввели уже пятнадцать субъектов, включая Санкт-Петербург. Некоторые при этом поступают вопреки логике – как, например, Краснодарский край, который, когда народ в отпускной сезон по причине закрытых границ (с Турцией, если что, авиасообщение возобновили только на днях) раскупил туры, объявил, что право на курортный отдых на Черноморье имеют право только люди с поставленной вакциной.
И почти никто почему-то не задумывается о том, что есть, скажем, категории граждан, которым прививка противопоказана. Или что после прививки, даже если она есть, антитела вырабатываются спустя полтора месяца, поэтому сам факт наличия заветного QR-кода вовсе не является оберегом.
Нет, Царьград не против вакцинации как формы защиты от ковида. Однако мы считаем, что принцип добровольности, провозглашённый в этом деле президентом, должен соблюдаться, а сегрегация на привитых и непривитых неприемлема.
Но чтобы население само осознало необходимость этого, ему надо разъяснять, зачем и почему лучше поставить прививку, чем не поставить. Кому – можно. Кому – нельзя по определённым показаниям.
Тем не менее констатируем: ситуация по всем приметам может оказаться хуже той, что мы уже пережили.
Одна из причин этого – мутации коронавируса. Сейчас по Москве – и постепенно распространяясь по всей стране – нагло шествует новый штамм ковида: уже не уханьский, с которого всё начиналось, и даже не британский, вызвавший в начале весны опасения, а индийский – более агрессивный и страшный. Но и он ещё, возможно, только предтеча следующей напасти, его последующей трансформации, которая ещё опаснее.
Что за зверь?
Согласно официальным сообщениям, на долю индийского штамма, получившего название «Дельта» и распространившегося уже в 80 странах планеты, приходится 90 процентов выявляемых в настоящее время москвичей, которым поставлен диагноз «коронавирусная инфекция».
По последним данным, он в шесть раз заразнее «классического» китайского, британского (носит название «Альфа» по классификации ВОЗ), южноафриканского («Бета») и бразильского («Гамма»).
Как он к нам попал?
В Индии – очень высокая плотность и численность населения и крайне слабое здравоохранение. Но главное – в разгар пандемии там проводились не просто массовые мероприятия, а масштабные действа с участием десятков и сотен тысяч людей одновременно.
А сообщение с Индией по большому счёту не ограничивалось.
Первые образцы «Дельты» были выявлены там ещё в середине прошлой осени, к зиме она была идентифицирована как самостоятельный штамм, а к началу весны 2021-го больше половины всех заболевших в Индии были инфицированы именно «Дельтой».
Это раньше проходил год, прежде чем чума попадала на новые континенты – пока туда заболевший доберётся. А сейчас – буквально три-четыре часа на самолёте, и вирус у нас. Миграционные массы, те же студенты прилетают сюда – встречаются, обнимаются. Вот и всё,
– объясняет в беседе с «Первым русским» врач-инфекционист Евгений Тимаков.
Как распознать?
Зарубежные эксперты рассказывают, что среди основных симптомов – головная боль, насморк, боль в горле, лихорадка, кашель, кишечные проявления. То есть он маскируется под сезонные вирусные инфекции, которые есть летом, поэтому распознать очень тяжело в первые дни, отмечает Тимаков.
А потом идёт нормализация состояния, человек считает, что он выздоравливает, начинает ходить на работу, думая, что всё прошло, а сам является при этом активным распространителем инфекции. А затем – резкое ухудшение, буквально за несколько дней, прогрессивно, и человек попадает в больницу. Ещё раз: этот штамм обходит иммунные барьеры, маскируется. И растёт, соответственно, число тяжёлых больных,
Но! Главное отличие «индийской заразы» от «классической», пришедшей в мир из Уханя, в том, что у заболевшего может и не пропадать обоняние. Что означает буквально – нет того маркера, симптома, который прежде указывал в большинстве случаев на коронавирус.
Этот штамм – более хитрый, научившийся мимикрировать и обманывать и наши организмы, и докторов.
Изначально тот вирус воспринимался как довольно контагиозный, но нужны были, с одной стороны, «вирусная нагрузка», а с другой – определённое время нахождения с источником инфекции, а вот индийский – значительно более активный.
В чём его опасность?
Нынешний штамм, продолжает Евгений Тимаков, более быстрый, он «уходит» от нашего иммунитета, организм его не воспринимает как угрозу и медлит с иммунным ответом. И пока он раздумывает, как быть, за это время вирус успевает поразить клетки во всех органах, и когда организм всё-таки соображает, что вирус уже есть, включается иммунный ответ, который, чтобы избавиться от врага, разрушает клетку. Соответственно, идёт агрессивная атака на свои клетки, и получается ухудшение.
Справятся ли вакцины?
На данном этапе мировой мониторинг вакцин показал, что вакцины могут бороться с индийским штаммом, но эффективность снижается до 70–90 процентов.
Потому что снижается тот иммунный ответ, о котором говорит доктор Тимаков.
В Центре им. Гамалеи сообщили, например, что там разработан спецкомпонент для «Спутника V», способный защитить от индийской мутации.
Но хуже то, что возникает теперь другая разновидность индийского штамма – «Дельта плюс», и она уже выявлена в России.
Чащ–е всего мутации происходят у людей из группы риска – со сниженным иммунитетом, у которых вирус в организме циркулирует долго: у онкобольных, в частности. И именно поэтому, когда вирус находился в организме долго и не был сразу пойман, нужны активные нейтрализующие антитела – не просто антитела, а активные, подчёркивает эксперт. А после перенесённой болезни активность антител снижается, что даёт вирусу обмануть иммунный барьер и пройти дальше.
Третья волна: чего нам ждать?
Третья волна, по мнению Евгения Тимакова, на самом деле стартовала ещё в середине апреля, когда началось увеличение госпитализаций. Просто этого никто из обывателей не увидел, поскольку все смотрели на статистику. Но вирусу-то, как уже говорилось, нужен некоторый срок, чтобы освоиться.
Британский штамм был завезён зимой, весной он начал поднимать голову, но тогда же «подъехал» индийский – более агрессивный, чем тот, с Туманного Альбиона: он его «подвинул» и начал заражать население. Как раз и прошло полтора-два месяца.
Между тем одновременно с ростом госпитализаций стали снижаться цифры по выздоровлению – потому что болезнь протекает тяжелее. И сейчас, прогнозирует Тимаков, будет больше «тяжёлых» в стационарах.
Соответственно (мы помним это по прошлой весне), постепенно коечный фонд начнёт перегружаться, и забирать всех в больницы уже не получится.
Между тем заболеваемость «молодеет» – дети чаще стали подхватывать коронавирусную инфекцию, но их вакцинировать, во всяком случае пока, не надо: во-первых, нужно время для окончательного тестирования вакцин, а во-вторых, процент тяжёлых случаев у детей пока на том же уровне, как у взрослых, прошедших вакцинацию (они ведь тоже могут попасть в больницу после прививки).
Когда всё закончится?
Вирус активно видоизменяется, новые штаммы пришли к нам в тот момент, когда они являются сильнее других типов, и если они снова мутируют раньше, чем сформируется популяционный иммунитет, соответственно, он будет циркулировать постоянно.
Эта зараза действительно очень надолго, отмечает инфекционист Евгений Тимаков.
Потому что когда давались изначальные эпидпрогнозы по коронавирусу (уханьскому), всё было понятно – буквально по датам: когда будет первая волна, когда она сойдёт, когда наступит вторая. И было проще рассчитать процент, чтобы сформировать популяционный иммунитет. Но потом появились активные мутации, и определённости теперь никакой нет. Хотя по британскому штамму катастрофы никакой тоже не было. Однако после трансформации в новые опасные штаммы – всё, теперь вирус будет меняться до тех пор, пока он не сможет передаваться легко, чтобы сам по себе мог передаваться и жить,
Хуже, подчёркивает специалист, что негативные последствия коронавируса мы только начинаем пожинать в полной мере – в виде роста онкологических заболеваний, снижения репродуктивной функции у женщин, вообще – обостряются хронические заболевания в течение шести месяцев: язвы, суставы, артриты, диабеты.
Коронавирус дойдёт до всех, и у каждого второго будут последствия,
«Вероятно, следующий суперштамм выскочит откуда-то из-за спины у «Дельты»
Суперштамм коронавируса, подобный «Дельте», может возникнуть где угодно, заявил в интервью «Известиям» вирусолог, ведущий научный сотрудник Национального центра биотехнологической информации Национальной медицинской библиотеки Национальных институтов здравоохранения США, признанный эксперт в эволюционной и вычислительной биологии Евгений Кунин. Проанализировав около миллиона геномов SARS-CoV-2, ученый пришел к выводу, что ни один из существующих вариантов не может конкурировать с «Дельтой». Однако это не означает, что будущий суперштамм будет порожден именно этой ветвью. Впрочем, чтобы стать успешным конкурентом «Дельте», коронавирус должен пройти по узкой тропинке: перестать хорошо реагировать на антитела, но начать лучше взаимодействовать с рецепторами клеток. По мнению Евгения Кунина, патогену уже довольно сложно совершить такой «рывок», поэтому, вероятно, «Дельта» останется самым агрессивным штаммом SARS-CoV-2.
Конкурент для «Дельты»
— Сколько геномов коронавируса вы проанализировали?
— Около миллиона. Но это было примерно три месяца назад, сейчас уже, конечно, больше. Компьютерные возможности не успевают за накоплением этих данных, и, как штаны ни задирай, за этим комсомолом не угонишься. Нужны другие подходы. Быть может, квантовые компьютеры. Сейчас для анализа никаких нормальных мощностей не хватает.
— Тем не менее вы лучше всех на планете Земля представляете себе уже ветвистое древо вариантов коронавируса. Как оно выглядит?
— Дерево как дерево — ветвится. Оно имеет достаточно четкую структуру, там можно выделить группы ветвей. За каждой веточкой стоят конкретные изоляты, геномы. Мы можем прослеживать их судьбу в динамике, во времени и в пространстве: что с ними происходило в Европе, в Северной и Южной Америке, в Австралии и так далее. Они имеют разные судьбы — это очень хорошо видно.
— И сейчас абсолютно очевидно, что штамм «Дельта» доминирует?
— Да, «Дельта»-вариант явно победил по всему миру. Не полностью вытеснил, но сильно потеснил все остальные.
— Сейчас с «Дельтой» не может конкурировать никакой из существующих вариантов?
— Мы не видим, чтобы какой-то вариант был способен всерьез конкурировать с ним.
— В будущем любой конкурентный штамм будет порождением «Дельты»?
— Это совершенно необязательно. Если бы этот штамм полностью — от слова «целиком» — вытеснил все остальные варианты, тогда конечно. Но остальные варианты где-то всё равно продолжают персистировать. Достаточно вероятно, что следующий суперштамм выскочит откуда-то из-за спины у этой «Дельты».
— Из-за спины — значит, будет порождением другой ветки?
— Вполне может быть. Тут важное значение приобретает эпистаз, — весьма традиционное понятие в генетике, которое обозначает взаимодействие между разными мутациями. Допустим, есть мутация А с каким-то определенным эффектом, а потом возникает мутация В. По умолчанию эффект А и В представляет собой их сумму. В общем, ничего интересного. Но в жизни бывает не так. Иногда эффект В на фоне А значительно сильнее, чем эффект того же В, если А отсутствует. Таким образом вирус может получить новые свойства. Поэтому возможно, что вариант, который заместит «Дельту», если такое произойдет, возникнет откуда-то слева.
— Еще в самом начале пандемии, когда «Дельты» не существовало, специалисты с опаской поглядывали на Индию как на возможный источник такого суперштамма. Они связывали это с большим населением, плохой гигиеной и слабой медициной. Можно ли сейчас предположить, в какой стране может возникнуть следующий суперштамм?
— Суперштамм может возникнуть абсолютно где угодно. Однако если говорить о вероятности, то, конечно, важны большая популяция самого вируса и возможность размножаться. Соответственно, для этого нужно много хозяев, то есть людей. Поэтому в среднем, конечно, эти варианты возникают в странах, где много людей. Однако возможности вируса не бесконечны. Когда у вас большой Хирш при большом количестве публикаций (индекс Хирша — количественный показатель продуктивности ученого, который высчитывается на основе количества цитирований их статей. — «Известия»), дальше его увеличивать сложно. Так же и с вирусом! Когда он достиг большой приспособленности, большой инфекционности, еще увеличить ее довольно трудно.
— То есть «Дельта» — это потолок для коронавируса?
— Не воспринимайте это как оптимистическое предсказание. Но, возможно, на фоне всех происходящих процессов, в том числе вакцинации, вариант более агрессивный, чем «Дельта», просто не распространится. На практике это не означает, что более агрессивные варианты невозможны в принципе. Но чтобы это произошло, нужно уже несколько мутаций. Есть предположение, что на фоне вакцинации такой вариант захватить популяцию уже не успеет.
«Задача для вируса нетривиальная»
— Существуют ли какие-то научные методы, чтобы оценить потенциал вируса?
— Это очень правильный вопрос. Методы существуют, но они несовершенны. Мы в своей работе, которая пока что находится в виде препринта на в bioRxiv, попытались это сделать. У вируса имеется шип, и этот самый шип взаимодействует как с рецептором (для проникновения в клетку человека), так и с антителами (которые защищают от проникновения в клетку человека). И тут возникает то, что называется компромиссом. Нужно сохранять способность хорошо связываться с рецептором, но одновременно уходить от связывания антител. Это непросто, так как эти участки в геноме накладываются друг на друга. Задача для вируса нетривиальная.
— И коронавирус в своем совершенствовании должен пройти по этой узкой тропинке?
— Да. Мы представили в нашей работе некоторые результаты. Они интересны, так как доказывают, что путь к возникновению такого рода мутантов, которые перестанут хорошо взаимодействовать с антителами, но будут по-прежнему хорошо и даже лучше взаимодействовать с рецептором, очень труден. Утешительная новость также состоит в том, что у варианта «Дельта» эта тропинка особенно узка.
— А у других вариантов?
— Есть вариант «Гамма», который в этом контексте «сделан» более удачно, поэтому на него нужно обращать внимание. «Гамма» тоже значительно задействован в пандемии.
— Вы представляете эту пандемию в виде волн? Или она для вас лишь дерево ветвями?
— Волны есть, и они происходят по понятным причинам. Действительно, в самом дереве это увидеть трудно, хотя и возможно. Волны связаны с возникновением высокоприспособленных вариантов. Сейчас мы видим волну «Дельты». Но она постепенно идет на спад. Будет ли следующая, большой вопрос.
— Что было бы, если бы пандемия началась с «Дельты»?
— Пандемия не могла бы начаться с «Дельты», потому что до этого вирус должен был уже некоторое время находиться в человеческой популяции.
«Вакцина всё равно не будет работать на 100%»
— Вакцины влияют на эволюцию коронавируса?
— Это очень интересный вопрос. С одной стороны, они эту эволюцию подавляют и замедляют совершенно очевидным образом. С другой стороны, могут возникнуть ускользающие варианты. Впрочем, из эпидемиологических данных становится очевидным, что это дело нелегкое для вируса по причинам, которые я упоминал. У нас существенная вакцинированная популяция имеется уже месяца четыре, и серьезного распространения по ней новых вариантов мы не видим.
— Вакцина, созданная на основе уханьского варианта коронавируса, может быть бесполезной, если есть угроза заражения «Дельтой»?
— Вакцина на основе уханьского штамма действует на вариант «Дельта» примерно так же, но сам этот вариант очень агрессивный, и он пробивает эту защиту. То есть антитела после вакцинации (защита) с ним связываются, в общем, не хуже, чем с уханьским вариантом. А с рецептором клетки (нападение) «Дельта»-вариант связывается лучше.
Будет ли эффект, если мы сейчас начнем заменять вакцину от уханьского варианта на вакцину против «Дельты»? Думаю, что особенно драматического эффекта не будет. То есть вакцина всё равно не будет работать на 100%. Подозреваю, что именно по этой причине, которая известна не только мне, очень активной работы по замене вакцины не ведется.
— Год назад вы говорили, что коллективного иммунитета, скорее всего, не будет. Вы продолжаете так думать?
— Это как было, так и остается очень сложным вопросом. Нужно пересчитывать все эти модели, исходя из особенностей «Дельты». Не исключено, что в силу большей агрессивности этого варианта, коллективный иммунитет всё же сформируется.
— Коллективный иммунитет надо высчитывать, исходя из особенностей конкретного штамма?
— Абсолютно верно. А также исходя из конкретных условий карантинных мер, плотности населения и т.д. Это совершенно не свойства коронавируса, это проблема популяционной генетики конкретного паразита. Вирус оспы чрезвычайно агрессивен, убивает много людей, но от него устанавливается коллективный иммунитет как за счет вакцинации, так и естественным путем. От вирусов менее агрессивных коллективного иммунитета быть не может: они персистируют в популяции, и возникает то, что называется эндемическим равновесием. К риновирусам, которые, я уверен, неоднократно вызывали у вас насморк, нет никакого коллективного иммунитета, живут они с нами и живут. SARS-CoV-2 тем и плох, что он находится где-то посередине по своим характеристикам. Очень сильно популяционный иммунитет для таких вирусов зависит от конкретной ситуации: от изолята, плотности населения в разных местах, карантинов и вакцинации.
Ход эволюции
— Вы изучали фуриновую вставку в коронавирусе, которую многие специалисты считают подозрительной. Некоторые утверждают, что ее вставили вручную. Что сейчас понятно про нее?
— Мы действительно сделали такую работу. Она не столько про фуриновую вставку, сколько вообще про разные вставки. Мы выяснили, что во многих геномных исследованиях по чисто техническим методологическим причинам такие вставки пропускаются, то есть, их не замечают компьютерные программы. Это проблема для исследований. Если же говорить про конкретную вставку, то выявить ее источник мы не сумели. На мой взгляд, есть все основания в отсутствие других данных думать, что и фуриновая вставка возникла в ходе эволюции коронавируса, а не каким-то другим искусственным путем.
— Ранее вы говорили, что, возможно, вакцина будет лучше защищать от COVID-19, нежели перенесенное заболевание. Вы остаетесь убежденным в этом?
— Мой энтузиазм в этом вопросе несколько уменьшился. Пока на этот счет поступают очень разноречивые данные, и четкого вывода сделать невозможно.
— Вы собираетесь выступать на форуме OpenBio в наукограде Кольцово (Новосибирская область), который открывается на днях. Это значимая площадка для исследователей и предпринимателей в сфере наук о жизни. Про что расскажете?
— OpenBio — это некая организация, которая пытается наладить взаимоотношения между учеными и бизнесом, культурными учреждениями, распространить научные знания в другие сферы деятельности и культуры, что, с моей точки зрения, идея очень хорошая. Что касается моего доклада, у меня идея фикс во времена пандемии рассказывать о мире вирусов. Это действительно целый огромный мир с фантастическим разнообразием по любым параметрам. В последние годы перед началом пандемии многим моим коллегам и мне удалось больше понять про это разнообразие, эволюцию и структуру вирусного мира, грубо говоря, навести там достаточный порядок. Мне кажется важным, чтобы люди представляли себе как место какого-нибудь SARS-CoV-2 в вирусном мире — так же как мы должны понимать свое место во Вселенной.
Закончивший МГУ имени М.В. Ломоносова вирусолог Евгений Кунин — один из самых цитируемых ученых современности. Его индекс Хирша составляет 219. У самого цитируемого российского ученого этот показатель равен 98. В 2017 году Semantic Scholar (поисковая интернет-платформа научных публикаций) включил Евгения Кунина в десятку самых влиятельных биологов мира. Основные исследования ученого включают сравнительный анализ секвенированных геномов и автоматические методы изучения функций генов. Сейчас Евгений Кунин занимается изучением и сравнением различных вариантов SARS-CoV-2.